0.0

Yazarlar:
SEMA ÖZTÜRK BİLGESU TARHAN EMRE AKTAŞ NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK
Yayın Yılı:
2024
Yayıncı:
ASES Congress Organization Publishing
Dil:
Özet (AI):
SARS-COV’un neden olduğu pandemide milyonlarca insan vefat etmiş ve bu sebeple virüsler üzerine yapılan çalışmalar hızlanmıştır. Mevcut çalışmamızın bir amacı Dünya Sağlık Örgütüne göre pandemi potansiyeli olabilecek Marburg virüsünün Glikoprotein(yüzey proteini) ve virion oluşumu/salınımı için kritik olan VP24 ve VP40 proteinlerinin mutasyonlarını belirlemekti. Diğer amacımız ise Glikoproteinde belirlenen mutasyonların konakçı hücreye girişinde kritik rol alan TAM ailesi reseptörleriyle etkileşimini etkileyip etkilemediğini in silico yöntemlerle incelemektir. Çünkü Glikoprotein; virüsün hedef hücrelere bağlanma yeteneğini ve bu bağlantı aracılığıyla hücreye girişini yönlendiren kritik bir bileşen olarak görev yaptığı için bu proteinin detaylı biyoinformatik analizleri, virüsün enfeksiyon mekanizmasının anlaşılmasında hayati bir rol oynayabilir, ayrıca immün sistemi etkileyebilme kabiliyeti, bağışıklık tepkilerini düzenlemek ve tedavi stratejileri geliştirmek için olası yaklaşımları da vurgulayarak, Glikoproteini Marburg virüsünün biyolojisi ve enfeksiyon süreçlerinin anlaşılmasında önemli bir bileşen olarak öne çıkmaktadır. Bu kapsamda öncelikle MEGAX kullanılarak Glikoprotein, VP24 ve VP40 proteinlerinin mutasyonları tespit edildi. Glikoproteinin mutasyonları Missence3D uygulamasıyla incelendi, yapıya etki eden mutasyonlar belirlendi. TAM ailesi reseptörleri trRosetta ve Phyre2 uygulamaları kullanılarak 3 boyutlu hale getirilerek docking için uygun formata getirildi. Normal ve belirlenen mutasyonlu glikoproteinin üç boyutlu yapısı baz alınarak TAM ailesi reseptörlerinin kenetlenmesinde (docking) olası mutasyonların bu yapıyı potansiyel olarak nasıl etkilediği belirlendi. Elde edilen sonuçların sadece Marburg virüsü için değil Ebola virüsü gibi bu virüsün içinde bulunduğu ailenin üyeleri ile ilgili çalışmalara da önemli bir kaynak olacağı düşünülmektedir.

II. INTERNATIONAL SCIENCES CONFERENCE

Yazarlar:
SEMA ÖZTÜRK BİLGESU TARHAN EMRE AKTAŞ NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK
Yayın Yılı:
2024
Yayıncı:
ASES Congress Organization Publishing
Dil:
Özet:
(AI):
Millions of people lost their lives in the pandemic caused by SARS-COV, and therefore studies on viruses accelerated. One of the aims of our current study was to identify mutations in the Glycoprotein (surface protein) of Marburg virus, which may have pandemic potential according to the World Health Organization, and in the VP24 and VP40 proteins, which are critical for virion formation/release. Our other aim is to examine with in silico methods whether the mutations determined in the glycoprotein affect the interaction of the glycoprotein with TAM family receptors, which play a critical role in its entry into the host cell. Because Glycoprotein; Detailed bioinformatics analyzes of this protein may play a vital role in understanding the infection mechanism of the virus. Because this protein also serves as a critical component that directs the virus's ability to bind to target cells and enter the cell through this connection. as the ability to influence the immune system, possible approaches to modulate immune responses and develop treatment strategies. To emphasize, its glycoprotein stands out as an important component in understanding the biology and infection processes of Marburg virus. In this context, firstly, mutations of Glycoprotein, VP24 and VP40 proteins were detected using MEGAX. Mutations of the glycoprotein were examined with the Missence3D application and mutations affecting the structure were determined. TAM family receptors were rendered 3D using trRosetta and Phyre2 applications and brought into a format suitable for docking. Based on the three-dimensional structure of the normal and identified mutated glycoprotein, it was determined how possible mutations in the docking of TAM family receptors potentially affect this structure. It is thought that the results obtained will be an important resource not only for the Marburg virus, but also for research on the family members to which this virus belongs,such as the Ebola virus.